FC Groningen pikte de jonge Arjen Robben al vroeg op bij amateurclub VV Bedum. Men was daar al snel overtuigd van zijn kwaliteiten. Er waren wedstrijden die met 20 - 0 werden gewonnen, waarbij Robben er achttien in legde. Als C-junior maakte hij op 12-jarige leeftijd de overstap naar FC Groningen.

Al op 16-jarige leeftijd maakte hij zijn debuut in het eerste elftal. In totaal zou hij 2 volledige seizoenen spelen bij FC Groningen. In 46 wedstrijden maakte hij maar 8 doelpunten. Ondanks dat hij weinig scoorde werd hij wel uitgeroepen tot Speler van het Jaar bij FC Groningen. Dit kwam vooral door zijn snelle aanvallen vanaf links en zijn opvallende acties. Zijn talent bleef niet onopgemerkt. De drie traditionele topclubs meldden zich voor de linksbuiten van FC Groningen. Ajax, Feyenoord en PSV wilden de linksbuiten graag hebben. Robben koos voor PSV en FC Groningen kreeg een transfersom van 9.500.000 gulden.